Ξεκίνησε τον Ιανουάριο του 2007 σε ένα ματς κόντρα στο Αιγάλεω με τον κόσμο του Παναθηναϊκού και όχι μόνο να τον ονομάζουν ”παιδί-θαύμα”. Ο Σωτήρης Νίνης είναι ο τρίτος νεότερος που έχει φορέσει τη φανέλα του Παναθηναϊκού στο πρωτάθλημα και δεύτερος στην Ευρώπη.
Το 2012 μετακόμισε στην Πάρμα για να επιστρέψει στην Ελλάδα και τον ΠΑΟΚ το 2013, και μετά από δύο χρόνια, το 2015 ξαναφόρεσε τα πράσινα για να φύγει εν τέλει για το Βέλγιο το 2016. Οι τραυματισμοί του δεν επιτρέπουν να παίζει πολύ, δοκιμάζει στον Ισραήλ και το καλοκαίρι του 2020 ο Βόλος τον ξαναφέρνει στην Ελλάδα.
Χθες στον αγώνα του Ιωνικού με τον Βόλο στη Νίκαια έφτασε τις 300 συμμετοχές, σε τέσσερις διαφορετικές χώρες και 12 διαφορετικές διοργανώσεις. Ο πρώην παίκτης του Παναθηναϊκού έχει 234 παιχνίδια σε πρωταθλήματα, 31 σε Κύπελλα και 35 στα Κύπελλα Ευρώπης. Έχει πετύχει συνολικά 26 γκολ σε αυτά τα 300 παιχνίδια.
